玉米RAV基因家族鑒定、密碼子偏好性及表達分析

摘要： 利用RAV基因特有結構域，通過pfam和HMMER軟件進行篩選剔除不完整或重復序列，從5個玉米自交系基因組中共鑒定出241個RAV家族成員，并使用鄰接法構建系統進化樹，將玉米和擬南芥RAV基因家族分為9個亞族。分析顯示，同一亞族RAV基因具有相似結構域、基因結構和motif分布。共發(fā)現87個共線性基因對，其中Zm-Oh43-RAV基因家族主要存在串聯重復基因對，其他4個玉米自交... （共12頁）