基于全基因組測序分析1起產(chǎn)氣莢膜梭菌導致的腹瀉暴發(fā)事件

摘要： 目的 對1起產(chǎn)氣莢膜梭菌導致腹瀉暴發(fā)事件進行病原學分析。方法 采集病例肛拭子樣本和環(huán)境涂抹樣本，肛拭子樣本增菌前后分別進行產(chǎn)氣莢膜梭菌plc和cpe基因熒光PCR檢測和產(chǎn)氣莢膜梭菌分離培養(yǎng)，對分離菌落進行全自動生化鑒定和飛行時間質(zhì)譜鑒定。對鑒定為產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離株進行全基因組測序，分析菌株攜帶毒力基因和耐藥基因情況，基于全部分離株核心基因組單核苷酸多態(tài)性進行遺傳聚集性分析。結(jié)... （共6頁）